Jak na nowoczesną atrakcję przystało Muzeum jest interaktywne – to swoiste teatrum, w którym goście biorą udział w interaktywnym pokazie, prowadzonym przez doświadczonych animatorów.

Na czas pokazu, odwiedzający stają się czeladnikami piernikarskimi Mistrza i Wiedźmy Korzennej, by własnoręcznie wyrobić ciasto piernikowe. Każdy może przygotować ciasto, żeby później przy użyciu drewnianych form uzyskać pożądany kształt i wypiec z niego toruńskie specjały, które następnie może zabrać ze sobą na pamiątkę. Klimat XVI-wiecznej piernikarni tworzony jest nie tylko poprzez wystrój wnętrza, stroje prowadzących i unoszące się zapachy, ale również dzięki możliwości słuchania legend o pierniku i Toruniu.